在澳洲大堡礁的深海中，小丑鱼爸爸玛林和儿子尼莫简单幸福的生活着，可是爸爸做事常常畏首畏尾，是个胆小鬼，尼莫觉得爸爸很不勇敢，甚至有点看不起自己的爸爸。小尼莫却天不怕地不怕，跟同伴们去水面玩耍的时候，竟然被渔网捞了起来，辗转被卖到一家牙医诊所。玛林对儿子的生死未卜感到十分的担忧，就算平时不能大胆行事，

音乐学家霍华德同未婚妻尤尼丝到了旧金山，此行的目的是为了得到拉雷比基金会颁发的2万美元的奖学金。霍华德随身携带的花格皮箱中装着收集来的火城岩石标本，那是用来证明音乐起源的重要证据。他们下榻在布里斯托尔旅馆。同时下榻在这家旅馆的三位客人恰巧也带着同霍华德一模一样的皮箱，更巧的是，他们同霍华德住在同一层